Custom Heroes est un jeu rapide semblable au Diafugo (alias The Great Dalmuti, etc.), l'objectif du jeu est de se débarrasser de toutes vos cartes plus vite que vos adversaires.
L'astuce dans Custom Heroes est que lorsque vous jouez, vous gagnez et dépensez des ressources qui vous permettent de "crafter" vos cartes à l'aide de pochettes de protections imprimées qui vont modifier la valeur et les capacités spéciales de vos cartes. Au fur et à mesure les cartes deviennent de plus en plus puissantes.

Custom Heroes utilise un système malin de points de victoire pour déterminer qui est le vainqueur final du jeu avec un mécanisme de pari qui peut permettre des retournements soudains en fin de parties.